Tháng 6 năm 2011, Fanning tốt nghiệp Campbell Hall School ở Bắc Hollywood, Los Angels, Mỹ[6] ở trường cô là thành viên trong đội cổ vũ và hai năm liên tiếp đăng quang danh hiệu "Nữ hoàng" trong ngày hội Homecoming.[7][8] Dakota theo học tại Đại học New York từ năm2011.[9]

Tháng 1 năm 2012, Fanning ký hợp đồng với công ty quản lý William Morris-Endeavor,[10] sau khi kết thúc việc hợp tác kéo dài 10 năm với công ty cũ là Osbrink Talent Agency.[11] Đến tháng 4 năm 2014, Fanning một lần nữa lại chuyển công ty quản lý và hiện nay là công ty Creative Artists Agency (CAA).[12]

Fanning bắt đầu hẹn hò với người mẫu Anh là Jamie Strachan vào năm 2013.[13] Dakota xác nhận chia tay sau khi hẹn hò được gần 3 năm vào khoảng tháng 10 năm 2016.[14]